MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012960	TG	3	6	39	44	0 %	50 %	50 %	0 %	253795548
2	NC_012960	TGTGC	2	10	53	62	0 %	40 %	40 %	20 %	253795548
3	NC_012960	ACA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795548
4	NC_012960	GCG	2	6	182	187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
5	NC_012960	TGA	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795548
6	NC_012960	CG	3	6	228	233	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
7	NC_012960	GCG	2	6	236	241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
8	NC_012960	GCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
9	NC_012960	GGC	2	6	259	264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
10	NC_012960	AGGCTG	2	12	316	327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253795548
11	NC_012960	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795548
12	NC_012960	TTTGA	2	10	421	430	20 %	60 %	20 %	0 %	253795548
13	NC_012960	TGGC	2	8	439	446	0 %	25 %	50 %	25 %	253795548
14	NC_012960	GTG	2	6	466	471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
15	NC_012960	GCG	3	9	491	499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795548
16	NC_012960	GC	4	8	518	525	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
17	NC_012960	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
18	NC_012960	GC	4	8	615	622	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
19	NC_012960	CGT	2	6	635	640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
20	NC_012960	TGC	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
21	NC_012960	CG	3	6	715	720	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
22	NC_012960	TGG	2	6	746	751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
23	NC_012960	TGC	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
24	NC_012960	GTC	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795548
25	NC_012960	GGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795548
26	NC_012960	CG	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
27	NC_012960	GC	3	6	1115	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
28	NC_012960	GCTG	2	8	1122	1129	0 %	25 %	50 %	25 %	253795548
29	NC_012960	CG	3	6	1130	1135	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
30	NC_012960	TTG	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795548
31	NC_012960	TG	3	6	1161	1166	0 %	50 %	50 %	0 %	253795548
32	NC_012960	TG	3	6	1203	1208	0 %	50 %	50 %	0 %	253795548
33	NC_012960	TGCG	2	8	1272	1279	0 %	25 %	50 %	25 %	253795548
34	NC_012960	GC	4	8	1353	1360	0 %	0 %	50 %	50 %	253795548
35	NC_012960	GCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795548
36	NC_012960	GCG	2	6	1503	1508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795549
37	NC_012960	GTG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795549
38	NC_012960	GT	3	6	1595	1600	0 %	50 %	50 %	0 %	253795549
39	NC_012960	GCT	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
40	NC_012960	ATG	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795549
41	NC_012960	TGG	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795549
42	NC_012960	GGC	2	6	1664	1669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795549
43	NC_012960	GCT	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
44	NC_012960	GC	3	6	1806	1811	0 %	0 %	50 %	50 %	253795549
45	NC_012960	CTGT	2	8	1827	1834	0 %	50 %	25 %	25 %	253795549
46	NC_012960	CAG	2	6	1842	1847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795549
47	NC_012960	GC	3	6	1851	1856	0 %	0 %	50 %	50 %	253795549
48	NC_012960	GC	3	6	1863	1868	0 %	0 %	50 %	50 %	253795549
49	NC_012960	CTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795549
50	NC_012960	GT	3	6	1881	1886	0 %	50 %	50 %	0 %	253795549
51	NC_012960	GTTTT	2	10	1917	1926	0 %	80 %	20 %	0 %	253795550
52	NC_012960	TGC	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
53	NC_012960	GC	3	6	2050	2055	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
54	NC_012960	CGGCTG	2	12	2062	2073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253795550
55	NC_012960	A	6	6	2116	2121	100 %	0 %	0 %	0 %	253795550
56	NC_012960	TAG	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
57	NC_012960	GCTG	2	8	2162	2169	0 %	25 %	50 %	25 %	253795550
58	NC_012960	ATG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
59	NC_012960	CGC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795550
60	NC_012960	AGC	2	6	2245	2250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
61	NC_012960	GGT	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795550
62	NC_012960	GC	3	6	2276	2281	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
63	NC_012960	GC	3	6	2284	2289	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
64	NC_012960	CGT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
65	NC_012960	GC	3	6	2418	2423	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
66	NC_012960	GCTA	2	8	2432	2439	25 %	25 %	25 %	25 %	253795550
67	NC_012960	AGCC	2	8	2463	2470	25 %	0 %	25 %	50 %	253795550
68	NC_012960	ACGGCG	2	12	2500	2511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253795550
69	NC_012960	CGCGG	2	10	2575	2584	0 %	0 %	60 %	40 %	253795550
70	NC_012960	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
71	NC_012960	GTA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
72	NC_012960	GC	3	6	2655	2660	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
73	NC_012960	CGG	2	6	2693	2698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
74	NC_012960	GCT	2	6	2740	2745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
75	NC_012960	TGC	2	6	2746	2751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
76	NC_012960	GC	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
77	NC_012960	GC	4	8	2761	2768	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
78	NC_012960	TGT	2	6	2801	2806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795550
79	NC_012960	GC	3	6	2817	2822	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
80	NC_012960	ACG	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
81	NC_012960	GCTA	2	8	2921	2928	25 %	25 %	25 %	25 %	253795550
82	NC_012960	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795550
83	NC_012960	GCG	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
84	NC_012960	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795550
85	NC_012960	GC	4	8	3066	3073	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
86	NC_012960	TG	3	6	3147	3152	0 %	50 %	50 %	0 %	253795550
87	NC_012960	CAAC	2	8	3192	3199	50 %	0 %	0 %	50 %	253795550
88	NC_012960	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
89	NC_012960	T	7	7	3282	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	253795550
90	NC_012960	GCTT	2	8	3304	3311	0 %	50 %	25 %	25 %	253795550
91	NC_012960	GCT	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
92	NC_012960	CA	3	6	3452	3457	50 %	0 %	0 %	50 %	253795550
93	NC_012960	AAG	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795550
94	NC_012960	GGC	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
95	NC_012960	TGAT	2	8	3643	3650	25 %	50 %	25 %	0 %	253795550
96	NC_012960	TGA	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
97	NC_012960	GCT	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
98	NC_012960	AGCA	2	8	3743	3750	50 %	0 %	25 %	25 %	253795550
99	NC_012960	CG	3	6	3790	3795	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
100	NC_012960	GCTG	2	8	3835	3842	0 %	25 %	50 %	25 %	253795550
101	NC_012960	TG	3	6	3848	3853	0 %	50 %	50 %	0 %	253795550
102	NC_012960	GGCG	2	8	3923	3930	0 %	0 %	75 %	25 %	253795550
103	NC_012960	CG	3	6	3946	3951	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
104	NC_012960	GAC	3	9	3954	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
105	NC_012960	GCCGTC	2	12	4010	4021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253795550
106	NC_012960	GAC	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
107	NC_012960	TGC	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
108	NC_012960	GC	3	6	4303	4308	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
109	NC_012960	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
110	NC_012960	GC	3	6	4361	4366	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
111	NC_012960	TTG	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795550
112	NC_012960	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
113	NC_012960	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	253795550
114	NC_012960	GGC	3	9	4522	4530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795550
115	NC_012960	GC	5	10	4545	4554	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
116	NC_012960	TGC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
117	NC_012960	ACG	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
118	NC_012960	CGA	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
119	NC_012960	CTA	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795550
120	NC_012960	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795550
121	NC_012960	CG	4	8	4702	4709	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
122	NC_012960	CAG	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795550
123	NC_012960	TGA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795550
124	NC_012960	TGGC	2	8	4788	4795	0 %	25 %	50 %	25 %	253795550
125	NC_012960	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795550
126	NC_012960	GC	4	8	5022	5029	0 %	0 %	50 %	50 %	253795550
127	NC_012960	GTG	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795551
128	NC_012960	GC	3	6	5178	5183	0 %	0 %	50 %	50 %	253795551
129	NC_012960	TGC	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
130	NC_012960	GCG	2	6	5240	5245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795551
131	NC_012960	GCT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
132	NC_012960	GC	3	6	5298	5303	0 %	0 %	50 %	50 %	253795551
133	NC_012960	TGG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795551
134	NC_012960	GC	4	8	5372	5379	0 %	0 %	50 %	50 %	253795551
135	NC_012960	GCT	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795551
136	NC_012960	GTT	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795551
137	NC_012960	CAC	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795551
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265	NC_012960	GCTG	2	8	10215	10222	0 %	25 %	50 %	25 %	253795557
266	NC_012960	T	7	7	10279	10285	0 %	100 %	0 %	0 %	253795558
267	NC_012960	C	6	6	10295	10300	0 %	0 %	0 %	100 %	253795558
268	NC_012960	A	7	7	10348	10354	100 %	0 %	0 %	0 %	253795558
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270	NC_012960	CAC	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795558
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400	NC_012960	GT	3	6	17135	17140	0 %	50 %	50 %	0 %	253795564
401	NC_012960	TGC	2	6	17170	17175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795564
402	NC_012960	TAT	2	6	17230	17235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253795564
403	NC_012960	AGC	2	6	17250	17255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795564
404	NC_012960	CAGC	2	8	17288	17295	25 %	0 %	25 %	50 %	253795565
405	NC_012960	AGCC	2	8	17344	17351	25 %	0 %	25 %	50 %	253795565
406	NC_012960	GC	3	6	17353	17358	0 %	0 %	50 %	50 %	253795565
407	NC_012960	ACG	2	6	17373	17378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795565
408	NC_012960	GC	3	6	17403	17408	0 %	0 %	50 %	50 %	253795565
409	NC_012960	AGC	2	6	17415	17420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795565
410	NC_012960	GCTA	2	8	17438	17445	25 %	25 %	25 %	25 %	253795565
411	NC_012960	GC	3	6	17477	17482	0 %	0 %	50 %	50 %	253795565
412	NC_012960	ACG	2	6	17566	17571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795565
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415	NC_012960	AGCT	2	8	17675	17682	25 %	25 %	25 %	25 %	253795565
416	NC_012960	GC	3	6	17708	17713	0 %	0 %	50 %	50 %	253795565
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422	NC_012960	GCTA	2	8	17930	17937	25 %	25 %	25 %	25 %	253795565
423	NC_012960	CAG	2	6	17978	17983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795565
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431	NC_012960	CGCGC	2	10	18492	18501	0 %	0 %	40 %	60 %	253795565
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433	NC_012960	GCT	2	6	18684	18689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795565
434	NC_012960	GCT	2	6	18696	18701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795565
435	NC_012960	GCT	2	6	18797	18802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795566
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442	NC_012960	CGT	2	6	19131	19136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795566
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453	NC_012960	GCT	2	6	19391	19396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795566
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466	NC_012960	GGCT	2	8	19969	19976	0 %	25 %	50 %	25 %	253795567
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500	NC_012960	GGGC	2	8	21187	21194	0 %	0 %	75 %	25 %	253795570

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